典藏物種統計11門 ,43綱, 192目, 811科,2558屬,4553種)
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科名 中文科名 學名 中文名 標本數
 節肢動物門 昆蟲綱 鱗翅目 Cossidae 蠹蛾科 Zeuzera sp.    1
 節肢動物門 昆蟲綱 半翅目 Pentatomidae 蝽科 Zicrona caerulea  藍蝽  5
 脊索動物門 哺乳綱 鯨目 Ziphiidae 喙鯨科 Ziphius cavirostris  柯氏喙鯨  3
 節肢動物門 昆蟲綱 鱗翅目 Lycaenidae 灰蝶科 Zizeeria maha okinawana  藍灰蝶  8
 節肢動物門 昆蟲綱 鱗翅目 Lycaenidae 灰蝶科 Zizina otis riukuensis  折列藍灰蝶  5
 節肢動物門 昆蟲綱 鱗翅目 Lycaenidae 灰蝶科 Zizula hylax  迷你藍灰蝶  4
 脊索動物門 鳥綱 雀形目 Turdidae 鶇科 Zoothera dauma dauma  虎斑地鶇(福建留鳥亞種)  75
 節肢動物門 昆蟲綱 鱗翅目 Nymphalidae 蛺蝶科 Zophoessa niitakana  玉山幽眼蝶  2
 脊索動物門 鳥綱 雀形目 Zosteropidae 繡眼科 Zosterops japonicus simplex  綠繡眼  20
 子囊菌門 糞殼菌綱 糞殼菌目 Lasiosphaeriaceae 毛球殼科 Zygopleurage zygospora  長雙頭孢殼菌  3
 子囊菌門 半子囊菌綱 酵母目 Saccharomycetaceae 酵母科 Zygosaccharomyces bisporus    1
 子囊菌門 半子囊菌綱 酵母目 Saccharomycetaceae 酵母科 Zygosaccharomyces fermentati    1
 子囊菌門 半子囊菌綱 酵母目 Saccharomycetaceae 酵母科 Zygotorulaspora florentina    1